报 告 人：陈国波 副研究员
报告题目：大规模医学遗传数据分析与实践
报告时间：2023年6月9日（周五）上午9：00
报告地点：静远楼1506
主办单位：数学与统计学院、数学研究院、科学技术研究院
报告人简介：
陈国波，2009年浙江大学数量遗传学博士，2011~2015年澳大利亚昆士兰大学大脑研究所博士后。2017年至今，浙江省人民医院临床医学研究所副研究员。从事统计遗传学研究，在Nature,Lancet,Am J Hum Genet,Hum Mol Genet,Bioinformatics,Mol Ecology等杂志发表论文40余篇，Google Scholar引用超3200次，H-index 19。
报告摘要：
医学遗传学数据逐渐涌现为数据挖掘与分析的重要场景，尤其DNA测序数据结合表型数据构成全基因组关联分析（Genome-wide association studies，GWAS）的规范数据格式，直接可以作为各类医学预测的数据源。但医学数据和DNA数据受到隐私保护的各类限制，现实中很难直接使用或者交互，极大限制了数据体量的扩增。本研究采用随机矩阵的计算框架，采用projection的方式，对基因型数据进行单向哈希加密，精准测算projection所需要的维度k与最终求解精度的量化关系，开发出适用于多方计算的encG-reg（encrypted genotype regression）。以两份真实世界的UKBiobank的约50万GWAS样本以及中国本土6个基因组相关研究所的约6万份GWAS样本，展示了如何在多方计算下采用encG-reg完成医学遗传学数据的亲属鉴定，以及将要展开的进一步工作内容和数据分析层面的各类挑战。